Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lamb3Q61087 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lamb3Q61087 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms