Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RNF123Q5XPI4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RNF123Q5XPI4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms