Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm27235Q3UW50 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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