Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC27Q2M243 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC27Q2M243 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms