Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cpne9Q1RLL3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cpne9Q1RLL3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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