Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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SKP2Q13309 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
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SKP2Q13309 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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SKP2Q13309 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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SKP2Q13309 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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SKP2Q13309 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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SKP2Q13309 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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SKP2Q13309 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
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SKP2Q13309 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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SKP2Q13309 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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SKP2Q13309 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
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SKP2Q13309 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SKP2Q13309 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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