Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPCQ01831 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPCQ01831 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPCQ01831 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPCQ01831 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPCQ01831 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPCQ01831 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPCQ01831 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPCQ01831 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPCQ01831 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPCQ01831 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPCQ01831 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
XPCQ01831 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPCQ01831 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPCQ01831 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPCQ01831 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPCQ01831 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPCQ01831 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPCQ01831 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XPCQ01831 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XPCQ01831 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XPCQ01831 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XPCQ01831 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XPCQ01831 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XPCQ01831 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XPCQ01831 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XPCQ01831 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XPCQ01831 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
XPCQ01831 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPCQ01831 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPCQ01831 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPCQ01831 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPCQ01831 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPCQ01831 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPCQ01831 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPCQ01831 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPCQ01831 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
XPCQ01831 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
XPCQ01831 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPCQ01831 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPCQ01831 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPCQ01831 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPCQ01831 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPCQ01831 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPCQ01831 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPCQ01831 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPCQ01831 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPCQ01831 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
XPCQ01831 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XPCQ01831 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
XPCQ01831 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XPCQ01831 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
XPCQ01831 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
XPCQ01831 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
XPCQ01831 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XPCQ01831 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
XPCQ01831 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
XPCQ01831 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
XPCQ01831 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
XPCQ01831 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
XPCQ01831 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
XPCQ01831 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
XPCQ01831 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
XPCQ01831 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
XPCQ01831 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
XPCQ01831 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
XPCQ01831 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
XPCQ01831 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
XPCQ01831 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
XPCQ01831 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
XPCQ01831 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
XPCQ01831 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XPCQ01831 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XPCQ01831 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
XPCQ01831 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XPCQ01831 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XPCQ01831 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XPCQ01831 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XPCQ01831 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XPCQ01831 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XPCQ01831 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XPCQ01831 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XPCQ01831 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XPCQ01831 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XPCQ01831 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XPCQ01831 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XPCQ01831 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XPCQ01831 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
XPCQ01831 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
XPCQ01831 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPCQ01831 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPCQ01831 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPCQ01831 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPCQ01831 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPCQ01831 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPCQ01831 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPCQ01831 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPCQ01831 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPCQ01831 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
XPCQ01831 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms