Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sycp3P70281 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sycp3P70281 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms