Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CASP9P55211 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP9P55211 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP9P55211 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP9P55211 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP9P55211 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP9P55211 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP9P55211 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP9P55211 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP9P55211 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP9P55211 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP9P55211 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP9P55211 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP9P55211 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP9P55211 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP9P55211 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP9P55211 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP9P55211 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP9P55211 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP9P55211 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP9P55211 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP9P55211 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP9P55211 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP9P55211 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP9P55211 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP9P55211 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP9P55211 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CASP9P55211 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CASP9P55211 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP9P55211 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP9P55211 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP9P55211 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP9P55211 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP9P55211 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP9P55211 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP9P55211 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP9P55211 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP9P55211 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP9P55211 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP9P55211 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP9P55211 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP9P55211 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CASP9P55211 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms