Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VEGFBP49765 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms