Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp2P29594 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Casp2P29594 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp2P29594 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Casp2P29594 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms