Protein–RNA interactions for Protein: P15692

VEGFA, Vascular endothelial growth factor A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFAP15692 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VEGFAP15692 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms