Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRP12270 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRP12270 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRP12270 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRP12270 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRP12270 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRP12270 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRP12270 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRP12270 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRP12270 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRP12270 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRP12270 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRP12270 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRP12270 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRP12270 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRP12270 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRP12270 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRP12270 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRP12270 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPRP12270 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRP12270 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRP12270 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRP12270 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRP12270 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRP12270 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRP12270 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TPRP12270 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TPRP12270 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TPRP12270 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TPRP12270 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TPRP12270 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRP12270 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRP12270 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TPRP12270 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRP12270 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRP12270 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TPRP12270 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRP12270 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRP12270 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPRP12270 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPRP12270 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPRP12270 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPRP12270 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPRP12270 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPRP12270 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPRP12270 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPRP12270 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPRP12270 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TPRP12270 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPRP12270 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPRP12270 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPRP12270 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPRP12270 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPRP12270 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPRP12270 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPRP12270 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPRP12270 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPRP12270 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPRP12270 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TPRP12270 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPRP12270 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TPRP12270 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPRP12270 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms