Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSCO60682 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSCO60682 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSCO60682 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSCO60682 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSCO60682 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSCO60682 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSCO60682 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSCO60682 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSCO60682 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MSCO60682 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSCO60682 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSCO60682 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSCO60682 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSCO60682 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MSCO60682 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSCO60682 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSCO60682 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSCO60682 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSCO60682 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSCO60682 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSCO60682 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSCO60682 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSCO60682 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSCO60682 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSCO60682 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSCO60682 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSCO60682 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSCO60682 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSCO60682 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSCO60682 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSCO60682 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSCO60682 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MSCO60682 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSCO60682 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSCO60682 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSCO60682 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSCO60682 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSCO60682 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSCO60682 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSCO60682 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSCO60682 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSCO60682 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSCO60682 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSCO60682 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSCO60682 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSCO60682 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSCO60682 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSCO60682 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSCO60682 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSCO60682 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSCO60682 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSCO60682 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSCO60682 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSCO60682 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSCO60682 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSCO60682 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSCO60682 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSCO60682 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MSCO60682 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSCO60682 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSCO60682 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSCO60682 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSCO60682 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MSCO60682 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MSCO60682 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MSCO60682 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MSCO60682 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSCO60682 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSCO60682 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSCO60682 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSCO60682 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSCO60682 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSCO60682 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSCO60682 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSCO60682 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSCO60682 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSCO60682 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSCO60682 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSCO60682 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MSCO60682 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSCO60682 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSCO60682 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSCO60682 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSCO60682 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MSCO60682 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSCO60682 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSCO60682 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSCO60682 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MSCO60682 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSCO60682 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MSCO60682 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSCO60682 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSCO60682 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSCO60682 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSCO60682 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSCO60682 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSCO60682 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSCO60682 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSCO60682 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms