Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ATP10AO60312 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP10AO60312 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms