Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P4

Ighv5-16, Immunoglobulin heavy variable 5-16 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-16A0A0B4J1P4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ighv5-16A0A0B4J1P4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms