Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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SNX13Q9Y5W8 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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SNX13Q9Y5W8 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
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SNX13Q9Y5W8 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
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SNX13Q9Y5W8 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
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SNX13Q9Y5W8 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
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SNX13Q9Y5W8 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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SNX13Q9Y5W8 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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SNX13Q9Y5W8 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 CDH18-210ENST00000511273 2318 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SNX13Q9Y5W8 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
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