Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 FRMD4B-210ENST00000478263 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 MARCH6-201ENST00000274140 9569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC7.67□□□□□ -1.18
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