Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q40

CDK15, Cyclin-dependent kinase 15, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK15Q96Q40 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 AL158835.1-204ENST00000449693 371 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CDK15Q96Q40 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CDK15Q96Q40 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDK15Q96Q40 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDK15Q96Q40 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDK15Q96Q40 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDK15Q96Q40 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDK15Q96Q40 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDK15Q96Q40 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDK15Q96Q40 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDK15Q96Q40 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDK15Q96Q40 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDK15Q96Q40 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDK15Q96Q40 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDK15Q96Q40 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDK15Q96Q40 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDK15Q96Q40 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDK15Q96Q40 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDK15Q96Q40 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDK15Q96Q40 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CDK15Q96Q40 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDK15Q96Q40 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDK15Q96Q40 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CDK15Q96Q40 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms