Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

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Length 1,119 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
LRIG3Q6UXM1 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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