Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC119150.1-201ENST00000507143 563 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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RNF20Q5VTR2 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
RNF20Q5VTR2 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
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