Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
GEN1Q17RS7 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms