Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ECM1Q16610 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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ECM1Q16610 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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ECM1Q16610 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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ECM1Q16610 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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ECM1Q16610 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
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ECM1Q16610 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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ECM1Q16610 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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ECM1Q16610 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
ECM1Q16610 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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