Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC090503.2-201ENST00000551135 981 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
TNXAQ16473 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms