Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC008770.4-201ENST00000586394 468 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
SKIV2LQ15477 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RN7SL561P-201ENST00000488553 281 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
SKIV2LQ15477 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
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