Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 MED6-207ENST00000554963 975 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
SIX1Q15475 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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