Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
SYCP1Q15431 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SYCP1Q15431 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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