Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC003687.1-201ENST00000578040 427 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 LINC01255-206ENST00000591431 441 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
HERC3Q15034 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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