Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
SMC1AQ14683 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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