Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 RNA5SP104-201ENST00000410989 118 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SEMA3AQ14563 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms