Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC090246.1-201ENST00000616499 426 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PDE1CQ14123 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms