Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC007495.2-201ENST00000562822 459 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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DDX39BQ13838 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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DDX39BQ13838 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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DDX39BQ13838 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
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DDX39BQ13838 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
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DDX39BQ13838 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
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DDX39BQ13838 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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DDX39BQ13838 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
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DDX39BQ13838 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
DDX39BQ13838 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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