Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC008568.1-203ENST00000433406 765 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 NECAP1P2-201ENST00000455668 727 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
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