Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 HSPA8P4-201ENST00000511877 1920 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CACNA1SQ13698 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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