Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEUROD1Q13562 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.2 ms