Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SMAD4Q13485 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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