Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
NME3Q13232 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
NME3Q13232 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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NME3Q13232 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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NME3Q13232 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
NME3Q13232 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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