Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
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PTPN13Q12923 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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PTPN13Q12923 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 SLCO1B1-201ENST00000256958 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
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PTPN13Q12923 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
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PTPN13Q12923 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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PTPN13Q12923 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
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PTPN13Q12923 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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PTPN13Q12923 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
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PTPN13Q12923 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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PTPN13Q12923 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPN13Q12923 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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