Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CNTN1Q12860 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms