Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
CENPEQ02224 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CENPEQ02224 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms