Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC068714.1-201ENST00000559623 800 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC098592.2-201ENST00000413158 265 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
PTPRDP23468 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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