Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 KAT14-201ENST00000377681 3483 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 PPIAP24-201ENST00000328558 471 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 SNHG5-219ENST00000623910 631 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
RABGEF1Q9UJ41 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 SCARNA5-201ENST00000516201 276 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 NAT1-209ENST00000541942 1948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
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