Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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HOXD1Q9GZZ0 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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HOXD1Q9GZZ0 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
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HOXD1Q9GZZ0 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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HOXD1Q9GZZ0 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
HOXD1Q9GZZ0 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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