Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
FOXQ1Q9C009 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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