Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B4

ANKRD42, Ankyrin repeat domain-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42Q8N9B4 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ANKRD42Q8N9B4 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121 ms