Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MIR5680-201ENST00000577577 84 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 AL356321.1-201ENST00000621360 228 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDKN3Q16667 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CDKN3Q16667 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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