Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 LINC01825-201ENST00000452381 850 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
FSCN1Q16658 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms