Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CTF1Q16619 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms