Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.58□□□□□ -2
SSX1Q16384 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SSX1Q16384 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SSX1Q16384 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.2 ms