Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CCDC6Q16204 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms